浮游菌和沉降菌含量是衡量手术室净化工程层级的重要依据，也是检测洁净度常用的方法，像浮游法检测手术室菌浓度等，那么在手术室净化工程中浮游菌和沉降菌有什么关系呢？

浮游菌浓度与沉降菌落数关系不确定，一方面沉降菌量只能说明其表面微生物的污染状况，而浮游菌量则反映车间内空气中生物粒子的浓度。另一方面手术室内细菌在空气中是不能单独存在的，常附在比它们大数倍的尘粒表面。所以空气中悬浮的或沉降到地面上的细菌，实际上是带菌的生物粒子，因而浮游菌与沉降菌的关系即是生物粒子与沉降的生物粒子之间的关系。

手术室净化工程中带菌粒子的粒径分布不同于在自然大气中的分布，又有送风气流的影响，浮游菌与沉降菌的关系必然不同于自然大气中的情形。美国国家航空和宇航局NASA标准中关于生物为例的规定，是国际上制定生物洁净室标准的蓝本，也反映了洁净车间内浮游菌与沉降菌的关系不可能相一致。国内已有不少关于二者关系的研究报告，得到的结果差异较大，说明不同用途的洁净车间，其浮游菌和沉降菌的关系不尽相同。
不同层级的手术室净化室，其浮游菌浓度与沉降菌落数的关系与各自具体的生产工艺等因素有关，且差异甚大，难以找出共同性的规律，《GMP设计规范》中二者控制指标的关系充分体现了这一点。

目前手术室净化工程的验收和日常手术室的自净检测，依靠的是沉降法（浮游法）检测和验收检测。

我们以千级手术室净化工程为例，两者的检测要求如下：