手术室净化工程是一项比较复杂的净化工程，安装时除了要注意设计方案之外，还要考虑现场施工的实际情况。

一般手术室净化工程的安装可以分为以下五个阶段：

1、毛坯准备阶段。
处在项目初期，整个楼层的混凝土已经浇筑完成，必要的保温和防水层已经处理完毕。之后净化工程公司进场，根据院方确定的设计图纸进行放线，规划每个房间的布局，同时准备接下来的框架材料。

2、框架搭建阶段。
根据每个房间放线的位置搭建框架，同时为层流箱留取必要的空间。基本框架搭建完毕后，整个手术室的雏形也就成型了。接下来将在吊顶空间内的施工。

3、层流布置和电气敷设阶段。
将一体成型的层流箱固定到手术室的吊顶中央，并与四周的框架固定。层流箱固定后，则开始敷设出风和送风管道。在整个吊顶空间内，最占据空间的就是出风和送风管道。根据层流箱的规格，出风和送风管道的大小不同；根据不同房间的位置，出风和送风管道的敷设方式和空间位置也不同。出风和送风管道的固定完成后，则开始敷设电源线路和气体管道。

4、内装阶段。
这个阶段是做手术室的内部装饰，主要包括墙面、顶面、地面的敷设，手术相关器械和储藏室的安装，吊顶面灯饰、消防、报警的安装。完成这一阶段后，整个手术室基本已经成型，可以准备测试验收。

5、测试验收阶段。
最后的收尾过程中，和设备安装息息相关的主要步骤包括气体管路保压测试、电源测试、相关手术器械和设备的测试，以及最重要的手术室净化层流测试。完成这一阶段后，层流净化手术室则可以开始投入正式使用了。